O deserto da Sibéria fica na região Trans-Baikal da Rússia, cerca de 480 quilômetros a leste do Lago Baikal. O deserto fica na tundra da Rússia, uma região fria, seca e plana com um mínimo de árvores crescimento. Ele está localizado entre as cadeias de montanhas Kodar e Udokan, perto da fronteira compartilhada com a China.
A Sociedade Geográfica Russa observa que o deserto tem apenas aproximadamente 7 milhas de comprimento por 3 milhas de largura. O centro populacional mais próximo é a capital distrital de Chara, que fica a cerca de seis quilômetros do deserto. As excursões turísticas ao deserto geralmente começam em Chara. Embora não haja estradas pavimentadas, o deserto da Sibéria pode ser acessado a pé, a cavalo ou em um veículo off-road.
