As principais massas de água na região sudeste dos Estados Unidos incluem o Lago Okeechobee na Flórida, o Golfo do México e o Rio Mississippi, que corre ao longo da fronteira oeste do Mississippi e para a Louisiana. Todos os três corpos da água contribuem para a economia e ecologia do Sudeste.
O Lago Okeechobee é o segundo maior lago dos Estados Unidos que fica completamente dentro das fronteiras do país. Também é extremamente raso, com uma profundidade média de 9 pés. O rio Mississippi é o terceiro maior rio da América do Norte, com 2.350 milhas. O Golfo do México, que faz fronteira com o Mississippi, Texas, Louisiana, Flórida e Alabama, é o nono maior corpo de água da Terra.