Francisco Pizarro descobriu e conquistou o Império Inca no que mais tarde se tornou o país do Peru. Quando ele estabeleceu o primeiro assentamento da Espanha no Peru, San Miguel de Piura, o líder Inca Atahualpa não aceitou a presença dos espanhóis. A Batalha de Cajamarca estourou como resultado, e Pizarro acabou capturando e, finalmente, executando, Atahualpa. Na presença desse vácuo de liderança, era simples para Pizarro tomar Cuzco, a capital inca, e levar todo o Peru para a Espanha.
A conquista do Peru por Pizarro e a conquista do México por Cortes ocorreram aproximadamente ao mesmo tempo. O feito de Pizarro foi visto como mais significativo porque ele trouxe menos guerreiros, enfrentou exércitos maiores e estava mais longe dos postos avançados de suprimentos espanhóis que forneciam provisões, armas e homens valiosos para o esforço de combate. Pizarro foi assassinado pelo filho de seu ex-amigo Diego Almagro, a quem Pizarro havia executado após uma série de brigas e a sangrenta Batalha de Las Salinas. Após seu falecimento, sua família ergueu um palácio em sua homenagem na Plaza Major de Truillo. Ainda hoje, ele continua sendo um tema de controvérsia no Peru, pois muitos o veem como a causa da destruição de grande parte da língua, cultura e religião indígenas no país.