Como eles não têm aberturas separadas para reprodução e excreção, a abertura intestinal posterior nos sistemas excretores dos tubarões é chamada de cloaca em vez de ânus. No sistema digestivo dos tubarões, o alimento passa por um único intestino curto e depois é expelido pela cloaca.
Nos tubarões, a comida passa primeiro pelo esôfago, onde extensões em forma de dedo evitam que a comida escape. Os estômagos dos tubarões são em forma de J e têm cerca de 20% de seu comprimento. As paredes musculares do estômago têm células que produzem ácido clorídrico, que amolece e dissolve os ossos, e muco, para proteger o revestimento do estômago. Anéis de músculos nas paredes do estômago realizam o peristaltismo para misturar e decompor os alimentos. O intestino é o local de absorção de nutrientes. Em humanos, os intestinos curtos e longos combinados medem cerca de 8 metros de comprimento, enquanto o intestino de um tubarão tem apenas 30 centímetros de comprimento, mas é muito mais largo. O intestino de um tubarão funciona muito lentamente para digerir os alimentos. Os humanos podem esvaziar a comida apenas 4 horas depois de comer, mas nos tubarões, o processo pode levar de 16 a 17 horas.
Outro método que um tubarão usa para eliminar os resíduos é virar o estômago do avesso. Quando tem matéria indigesta em seu estômago, expele seu estômago do avesso pela boca, enxágue o estômago com água do mar e o retrai para sua posição normal.
