É possível obter os três Pokémon iniciais - Bulbasaur, Charmander e Squirtle - em "Pokémon Yellow". Normalmente, um jogador tem que escolher um dos três e não pode adicionar os outros dois, a menos que o faça trocando Pokémon com outro jogador. Cada método usado para capturar os três Pokémon iniciais carrega um lembrete de um episódio do programa de TV Pokémon.
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Visite uma casa perto do Centro Pokémon Cerulean City
Visite a casa imediatamente a oeste do Centro Pokémon Cerulean City. Qualquer jogador cujo Pikachu está de bom humor descobre que a senhora da casa oferece um Bulbasaur que ela cuidou até a saúde, representando o cuidado de Melanie com Pokémon feridos no episódio "Bulbasaur e a Vila Oculta".
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Fale com o treinador perto da Ponte Nugget
Vá para a plataforma elevada ao norte da Ponte Nugget no canto noroeste da Rota 25. Fale com o treinador lá. Ele afirma que não é um bom treinador e oferece um Charmander. O treinador é uma reminiscência do abandono de Damien de seu Charmander no episódio "Charmander the Stray Pokémon."
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Fale com a oficial Jenny
Vença o Tenente Surge no Ginásio Vermilion para obter o Distintivo do Trovão. Então, vá para o meio da cidade para falar com a Oficial Jenny. Ela vira um Squirtle, alegando que ele é um criador de travessuras, assim como ocorreu no episódio "The Squirtle Squad".