Os jogadores não podem capturar Kyogre no jogo em Pokémon Soul Silver. No entanto, os jogadores podem transferi-lo por meio de Pal Park de vários outros jogos Pokémon.
Em Pokémon Heart Gold, os jogadores podem encontrar Kyogre na Embedded Tower, que é acessível a partir de uma caverna na Rota 47 se os jogadores tiverem o Blue Orb. Quando os jogadores alcançam o mesmo ponto em Soul Silver com o Red Orb em sua posse, eles encontram Groudon esperando por eles.
Os jogadores só podem obter Kyogre em Soul Silver trocando por ele ou importando-o de outro jogo. Kyogre está disponível na Cave of Origin em Pokémon Sapphire ou na Marine Cave em Pokémon Emerald. Como esses jogos estavam disponíveis apenas para o Game Boy Advance, eles exigem um modelo de Nintendo DS que tenha o slot de cartucho apropriado. Os jogadores que têm um modelo DSi ou 3DS não poderão obter Kyogre desta forma e devem trocá-lo ou usar uma cópia do Heart Gold.
Kyogre é um Pokémon lendário e em todos os jogos começa no nível 50. Os jogadores precisam estar em um nível bastante alto para vencer a batalha e devem estar preparados para fortes ataques de gelo e água.