O jacaré se adapta ao ambiente contando com sua pele camuflada, a posição de seus olhos e narinas, a capacidade de seus ouvidos se fecharem e seus órgãos especializados. Os pulmões e o coração do jacaré são adaptado a longos períodos de tempo submerso na água.
Uma das adaptações do jacaré ao seu ambiente reside nos pulmões e no coração especializados que o permitem ficar submerso com segurança na água. Os pulmões são protegidos por uma estrutura que evita que a água entre neles mesmo com a boca aberta. O coração é capaz de separar o sangue oxigenado do desoxigenado e enviar o sangue rico em oxigênio para o cérebro, para que o crocodilo possa ficar debaixo d'água por longos períodos de tempo.
Os olhos, nariz e orelhas do crocodilo também estão adaptados ao ambiente aquático. Tanto as narinas quanto os olhos estão localizados no topo da cabeça, de modo que ele pode ficar quase completamente submerso e ainda respirar pelas narinas. Quando os olhos estão submersos, uma membrana os protege e permite que o crocodilo veja.
Outra adaptação é a pele do crocodilo. A coloração cinza e as saliências e protuberâncias em seu corpo permitem que ele se misture com seus arredores, muitas vezes dando ao jacaré a aparência de um tronco e permitindo que ele se aproxime furtivamente da presa.
