Os crocodilos se reproduzem por cópula. A cópula geralmente ocorre na água e, se ocorrer a fertilização, a fêmea do crocodilo ficará grávida e porá seus ovos.
A cópula de crocodilo não acontece até que ocorra um namoro um tanto complexo. O crocodilo macho esfrega seu corpo contra a fêmea e, se ela for receptiva, faz vocalizações para que ele saiba que deve prosseguir.
Um crocodilo fêmea põe entre 12 a 48 ovos em um ninho após o acasalamento. Os crocodilos do Nilo cavam um buraco, depois depositam os ovos e voltam a enchê-los com terra. Os crocodilos de água salgada constroem um monte de terra e plantas para colocar seus ovos.
Os ovos eclodem após 2 a 3 meses, quando os filhotes de crocodilo estão totalmente desenvolvidos.