A geografia do império inca era em grande parte montanhosa e ocupava grande parte da costa oeste da América do Sul. Uma grande parte do império inca existia dentro de uma zona climática conhecida como tierra fria.
Em seu auge, o império Inca ocupou quase 2.500 milhas ao longo da montanhosa costa oeste da América do Sul, estendendo-se da atual Quito, Equador, ao sul de Santiago, Chile. A principal característica geográfica desta região é a Cordilheira dos Andes, uma área rica em diversidade geográfica. A região andina da América do Sul abrange uma extensão geográfica do deserto à floresta tropical e à geleira. Das próprias montanhas, do oeste à costa, é uma região de desertos. Oásis tornam a vida possível nesta região árida, mas o império Inca incluía um dos desertos mais brutais da Terra - o Atacama - partes do qual não sofreram chuvas na história humana registrada.
As terras baixas dos Andes sustentam florestas tropicais e savanas, enquanto altitudes mais altas se tornam florestas de nuvens. As florestas nubladas são frias e úmidas, com uma cobertura de nuvens que prevalece quase 300 dias por ano. O clima aqui apóia a vegetação e a vida selvagem que não são encontradas em nenhum outro lugar da Terra.
Uma característica importante do império Inca é o Lago Titicaca, entre as nações atuais do Peru e da Bolívia. O Lago Titicaca encontra-se em uma zona climática conhecida como tierra fria. A geografia e o clima únicos do lago fornecem algumas das melhores terras agrícolas da região.