Neil Cavuto foi diagnosticado com linfoma de Hodgkin estágio IV e esclerose múltipla progressiva secundária. Embora ele tenha sobrevivido ao câncer em estágio IV, a esclerose múltipla não tem cura. Ele afirmou em 2007 que às vezes tem dificuldade para andar e falar.
Cavuto teve linfoma de Hodgkin no final dos anos 1980. Quase uma década depois, em 1997, ele foi diagnosticado com esclerose múltipla após sofrer de sintomas de cegueira, formigamento e outras sensações estranhas. Cavuto continuou com seu trabalho como âncora de notícias, embora tenha sofrido períodos de perda repentina de visão ao tentar ler o noticiário. Ele começou a memorizar seus roteiros para evitar atrasos na transmissão.
Fadiga, dor de cabeça, atrofia muscular das pernas, perda de visão e perda da fala estão todos associados à EM. Como Cavuto tem EM progressiva secundária, é provável que piore progressivamente com o tempo. A medicação ajuda a permitir que Cavuto leve uma vida o mais normal possível.
Depois de ser diagnosticado, Cavuto começou a trabalhar como voluntário na National MS Society. Em 2015, Cavuto ainda trabalha para a Fox Business Network e o canal Fox News. Ele trabalha como comentarista e âncora de televisão e como apresentador de três programas de televisão. Ele mora em Nova Jersey com a esposa e três filhos.