No total, o Japão tem 6.852 ilhas. No entanto, esta definição inclui apenas ilhas com 100 metros de circunferência ou maiores; uma definição menos restritiva levaria a uma contagem muito mais alta, enquanto uma mais restritiva levaria a uma contagem mais baixa. Apenas 430 ilhas japonesas são habitadas.
A maioria das pessoas no Japão vive em quatro ilhas: Hokkaido, Honshu, Shikoku e Kyushu. Destes, Honshu é o maior e mais populoso por uma ampla margem; é também a sétima maior ilha do mundo, com um comprimento total de 810 milhas. Uma das menores ilhas do Japão, Aogashima, tinha uma população de apenas 205 pessoas em 2009, incluindo 25 estudantes.
