De acordo com o U.S. Marshals Service, um dos primeiros usos da impressão digital para fins de identificação data da antiga Babilônia, cerca de 4.300 anos atrás, quando os comerciantes usavam impressões digitais em tabuletas de argila para finalizar transações comerciais. O primeiro uso de impressões digitais para fins forenses em investigações policiais data de 1892, quando Juan Vucetich, um policial argentino, usou impressões digitais para identificar um criminoso pela primeira vez.
Culturas antigas na China, Pérsia, Grécia, Egito e Roma usaram impressões digitais para estabelecer identidade para muitos fins, incluindo como marcas de fabricantes em cerâmica, como decorações, para assinar contratos comerciais e para fazer empréstimos entre indivíduos específicos. Eles não usaram impressões digitais para identificar um indivíduo desconhecido na população em geral. Os registros legais mostram que durante a dinastia Qin, que durou de 221 a 206 a.C., os chineses coletaram impressões de mãos, pés e digitais como evidência na cena do crime. Ao longo dos séculos seguintes, cientistas e outros pesquisadores estudaram impressões digitais com o objetivo de desenvolver uma taxonomia de tipos e padrões. Os dados foram úteis em muitas disciplinas e provaram aos investigadores que as impressões digitais eram únicas e podiam ser usadas para estabelecer a identidade com certeza. Sir Francis Galton é creditado por identificar características de impressões digitais que ainda são usadas por investigadores criminais em 2014. O uso forense de impressões digitais se espalhou rapidamente durante o século 20, e em 1971 o FBI tinha 200 milhões de cartões de impressão digital em arquivo. Eles se tornaram o banco de dados do Sistema automatizado de identificação de impressões digitais.