Costuma-se dizer que o Homem-Aranha não tem nenhuma fraqueza específica, ou pelo menos nenhuma que seja parte integrante da trama no que diz respeito à fraqueza do Super-Homem em relação à criptonita. De acordo com o perfil do personagem da Marvel, Spider- O senso de aranha precognitivo do homem e as habilidades físicas sobre-humanas o tornam virtualmente imune a danos.
No entanto, o perfil do personagem do Homem-Aranha também afirma que ele pode se sabotar ao ignorar cognitivamente esses reflexos autônomos. Em outras palavras, a falta de fé em seus próprios instintos representaria uma séria fraqueza.
Sua dependência de seus instintos também pode ser considerada uma fraqueza. Por exemplo, quando um resfriado comum enfraqueceu seu senso de aranha em "The Amazing Spider-Man # 39" (1966), o Duende Verde ganhou uma vantagem distinta sobre ele.
Como muitos super-heróis, o Homem-Aranha também é vulnerável à eletricidade, bem como a laços familiares ou pessoais, como os problemas de saúde de sua tia May.
