O Alabama tem um grande número de espécies nativas, incluindo javalis, veados-de-cauda-branca, linces, raposas vermelhas e cinzas, coiotes, lontras de rio norte-americanas, gambás, guaxinins, gambás e tatus. O Alabama também é o lar de uma população diversificada de pássaros, insetos e répteis.
Algumas espécies que antes eram encontradas no Alabama foram expulsas do estado, como o alce, o bisão, o lobo vermelho e o puma. Algumas outras espécies, como o urso-negro, ainda são encontradas lá em 2014, mas em pequeno número. Também houve avistamentos não confirmados do jaguarundi, um pequeno gato parecido com uma lontra. Durante o verão, o peixe-boi ameaçado de extinção pode ser encontrado nas águas costeiras. O periquito da Carolina foi encontrado em todo o Alabama, mas foi levado à extinção pela perda de habitat.
O Alabama também é conhecido por sua pesca esportiva, especialmente seus bagres e lagostins. Cento e cinqüenta e oito espécies diferentes de pássaros se reproduzem regularmente no Alabama, enquanto 174 espécies adicionais passam o inverno lá. Isso inclui perus selvagens, aves de rapina, como falcões e falcões, pássaros marinhos, pica-paus e mergulhões-do-norte. O estado também possui 62 espécies de mamíferos e 93 espécies de répteis, incluindo o jacaré americano no sul do estado. Acredita-se que a cobra índigo oriental tenha sido extirpada do Alabama, mas foi reintroduzida a partir de 2010.