Os lêmures estão em perigo devido à destruição de seu habitat na floresta tropical. Outra causa é o desmatamento acelerado causado pelo aumento da pobreza como resultado da turbulência política nas regiões onde o lêmure vive. A caça também representa um risco para a população de lêmures.
Das 103 espécies conhecidas de lêmure, 91 por cento estão ameaçadas. Isso levou o lêmure de Madagascar a ser considerado o mais próximo de estar à beira da extinção pela Comissão de Sobrevivência de Espécies da União Internacional para a Conservação da Natureza. Um total de 23 espécies estão criticamente ameaçadas de extinção em 2015, cinquenta e duas estão em perigo e 19 estão listadas como vulneráveis. Os lêmures são os mais ameaçados de qualquer grupo de vertebrados.
