A maioria das teorias sobre a origem do nome colorido do Mar Vermelho está centrada em uma proliferação de bactérias vermelhas que aparece periodicamente em sua superfície, uma associação direcional ou sua associação com os Himiaritas, governantes de Sabá. Sem histórico registro especifica o motivo exato.
A resposta mais óbvia das três razões possíveis é a bactéria trichodesmium, frequentemente chamada de "serragem do mar", que flutua perto do topo da água e tem uma tonalidade avermelhada. Esta é a mesma bactéria que se forma na água do oceano sem oxigênio, às vezes causando uma "maré vermelha".
No mundo antigo, o vermelho era uma das várias cores associadas às direções. Preto era norte, vermelho era sul, verde era oeste e branco era leste. Essa teoria pressupõe que o Mar Vermelho era considerado como estando ao sul do antigo Oriente Próximo.
A última teoria é que o mar recebeu o nome dos Himiaritas, um povo que já viveu ao longo de suas costas perto do Iêmen e da Etiópia. Os himiaritas também eram associados à realeza de Sabá. A tradução livre de "Himyer" significa "vermelho" e Sheba é muito semelhante ao antigo hebraico "seba", ou vermelho. Embora seja incerto por que eles podem ter sido chamados de "povo vermelho", é possível que isso esteja relacionado ao famoso corante roxo real obtido do molusco murex, que foi ativamente colhido e processado na área. O roxo de Tyr, um deste grupo de tinturas, é mais próximo do vermelho e mancha as mãos dos tintureiros.