Guaxinins fazem suas tocas em árvores, cavernas, minas, tocas de marmota, celeiros e esgotos de chuva. Quando não conseguem encontrar árvores adequadas, os guaxinins podem fazer casas temporárias em casas humanas ou edifícios vazios.
Os guaxinins preferem viver em regiões de floresta úmida, onde têm fácil acesso a um suprimento de água confiável, mas também podem sobreviver em áreas tropicais, agrícolas e suburbanas. Como animais noturnos, os guaxinins freqüentemente passam horas descansando em suas tocas durante o dia. As tocas de árvores também são essenciais para proteger os guaxinins recém-nascidos, que ficam cegos nos primeiros 18 a 24 dias, de acordo com a Animal Diversity Web. Os guaxinins machos e fêmeas podem compartilhar tocas brevemente durante o acasalamento, mas, em geral, os guaxinins mães vivem sozinhos com seus filhotes.