O funeral de Annette Funicello foi realizado na Cherished Memories Memorial Chapel em Bakersfield, Califórnia. Foi uma cerimônia privada. Alguns relatos alegam que Funicello foi enterrado no Forest Lawn Memorial Park em Hollywood Hills, Califórnia, mas esses relatórios foram contestados.
Sra. Funicello tinha 70 anos quando faleceu de complicações relacionadas à esclerose múltipla, uma doença em que o sistema imunológico corrói a cobertura protetora dos nervos. Funicello anunciou publicamente sua saúde debilitada em 1992. Sinais que podem ter indicado que Funicello estava começando a sofrer de esclerose múltipla foram notados já em 1987, quando Funicello experimentou algumas crises de tontura enquanto trabalhava com o ator Frankie Avalon. Ela não abordou o assunto na época.
