O Instituto do Tempo no Pokémon Emerald está localizado na Rota 119. Servindo como um bureau para a região de Hoenn, ele monitora as condições do tempo em toda a região.
Quando o jogador chega ao instituto pela primeira vez, ele descobrirá que ele foi invadido pela Equipe Aqua ou pela Equipe Magma para buscar informações sobre o lendário Pokémon Kyogre (Equipe Aqua) ou Groudon (Equipe Magma) e o raro Pokémon Castform. Depois que o jogador derrotar o time que invadiu o instituto, um meteorologista vai premiar o jogador com o Castform.
O principal projeto do Weather Institute é uma máquina meteorológica que permite ao instituto controlar o clima em áreas da região de Hoenn. O primeiro andar possui um PC e uma cama onde o jogador pode descansar. O segundo andar é onde ficam os postos de trabalho do instituto e também é a área onde o pessoal é cercado pela equipe invasora.
