A principal diferença entre Nidoking e Nidoqueen é que eles vêm de linhas de gênero diferentes dos Nidoran. Na superfície, os dois Pokémon são quase iguais, com exceção dos números básicos. Eles possuem conjuntos de movimentos muito semelhantes, são ambos Poison /Ground Pokémon e vêm de linhas evolutivas semelhantes.
Essa disparidade de gênero é o primeiro e mais proeminente exemplo testemunhado na série Pokémon. O gênero como uma mecânica de jogo completa foi introduzido pela primeira vez na segunda geração de jogos, mas os nidorenses exibiram um exemplo básico do que viria a ser nas gerações posteriores. Mesmo nas versões mais recentes, as linhas de Nidoran exibem mais diferenças entre seus gêneros do que outras, pois são uma das poucas a desenvolver estratégias e pontos fortes diferentes, dependendo apenas de seu gênero.
As linhagens Nidoran são consideradas espécies separadas umas das outras, mas possuem compatibilidade perfeita entre si. Infelizmente, isso não vai até o fim de suas linhas evolutivas devido a peculiaridades de como a criação de Pokémon funciona no início da série. Estranhamente, uma vez que uma fêmea Nidoran evolui para uma Nidorina, ela perde toda a compatibilidade do ovo, tornando impossível cruzar com qualquer outra coisa que não seja um Ditto.