"O Alquimista" segue um pastor andaluz chamado Santiago enquanto ele viaja da Espanha para as pirâmides egípcias. Em seu caminho, ele encontra um alquimista e os dois viajam juntos para encontrar o tesouro sob o qual Santiago sonhou as pirâmides.
Santiago consulta um cigano e um velho mágico que lhe dizem para fazer a viagem. Ele é assaltado em Tânger, mas encontra trabalho com um comerciante de cristal. Santiago ensina o gentil comerciante a melhorar seu negócio, e os dois ficam ricos em um ano. Santiago viaja em caravana para o Egito, onde conhece um inglês que quer ser alquimista. A caravana refugia-se na cidade para evitar uma guerra tribal no deserto e Santiago encontra e apaixona-se por Fátima.
Depois de defender a cidade de um ataque, o alquimista e Santiago optam por continuar a "Lenda Pessoal" de Santiago para encontrar o tesouro nas pirâmides, deixando Fátima para trás. Eles são capturados e o alquimista dá à tribo todo o dinheiro de Santiago e diz a eles que Santiago pode se transformar em vento. Depois de três dias, Santiago pede ao vento e ao sol para criar uma tempestade de areia e ele desaparece no auge da tempestade.
Santiago é atacado novamente nas pirâmides, e um dos homens diz que costumava sonhar com um tesouro na Espanha. Santiago percebe que o sonho é sobre o lugar de onde veio e volta e encontra um grande tesouro. Ele retorna à cidade no deserto e se reencontra com Fátima.