O algodão Bt é uma versão geneticamente modificada da planta que contém genes para um inseticida. As plantas do algodão incluem Bacillus thuringiensis (Bt), uma bactéria formadora de esporos que produz proteínas cry. Quando os insetos comem essas plantas de algodão, as proteínas cry se ligam às células dentro do inseto, perturbando o fluxo de potássio através do inseto, acabando por matá-lo. O algodão Bt é produzido pela Monsanto e cultivado na Índia.
A família de bactérias Bt contém 200 proteínas que são prejudiciais a muitos insetos, especialmente besouros, larvas de borboleta, vermes do algodão, moscas e larvas de mariposa. Em áreas onde essas pragas são a principal ameaça ao algodão, o uso do algodão Bt reduz a necessidade de uso de inseticidas de amplo espectro nas lavouras. No entanto, o Bt é ineficaz contra outras pragas, incluindo pulgões e percevejos. Em algumas áreas da China, o uso de inseticidas aumentou para níveis pré-Bt em campos de algodão devido à necessidade de combater essas pragas resistentes ao Bt.
Nos Estados Unidos, o uso de algodão Bt rendeu aproximadamente 5 por cento a mais por acre do que o algodão padrão entre 1996 e 1998.
O algodão Bt é amplamente utilizado na Índia, o segundo maior país produtor do mundo. No entanto, como as sementes de algodão Bt da Monsanto são caras e não duram muito além de uma geração, os agricultores indianos desenvolveram sua própria variedade com sementes reutilizáveis. Embora o uso de algodão Bt seja controverso na Índia, 83% do algodão do país vem dele em 2012.
