Uma das maneiras mais fáceis de clonar Master Balls é usar a falha de clonagem Battle Tower na versão do jogo Pokémon Emerald. Os itens clonados no Pokémon Emerald, que é dos jogos Pokémon de terceira geração, também pode ser negociado em versões posteriores do jogo Pokémon.
Todos os itens mantidos pelo Pokémon durante o processo de clonagem na Battle Tower, como a Master Ball, também serão clonados. O jogador ganha acesso à Torre de Batalha depois de derrotar a Elite Four.
O seguinte mostra como clonar itens no Pokémon Emerald:
Etapa 1
Depois de entrar na Battle Tower, vá para o PC na extrema direita e deposite qualquer Pokémon.
Etapa 2
Faça o Pokémon segurar a Master Ball, desligue o PC e salve o jogo.
Etapa 3
Ligue o PC novamente e retire o Pokémon com a Master Ball. Vá até a mulher e entre em quaisquer dois Pokémon para a batalha.
Etapa 4
Quando perguntado se está tudo bem para salvar o jogo, escolha "Sim". Assim que a mulher pedir para salvar o jogo, reinicie o Game Boy Advance.
Etapa 5
Após o reinício do jogo, o Pokémon com a Master Ball estará de volta ao PC e também na bolsa de jogo do jogador.