Não é possível viajar para o espaço sideral em Pokémon Emerald. Os jogadores visitam o Centro Espacial Mossdeep ao longo do jogo, mas não podem embarcar em um foguete para ir para o espaço.
O boato de que é possível ir para o espaço provavelmente começou com o Pokémon Deoxys, que dizem vir do espaço. No entanto, o Deoxys é obtido na Ilha do Nascimento neste jogo. Os lançamentos de teste são conduzidos periodicamente na estação, e um cientista dá uma contagem atual dos testes bem-sucedidos, mas o jogador não pode participar deles de forma alguma. O número que o cientista fornece corresponde, na verdade, ao número de semanas que se passaram desde o início do jogo atual.
Ao longo do jogo, a Equipe Magma assume o controle do Centro Espacial e o jogador tem que retirá-lo deles. Este evento ocorre logo após o jogador ganhar o Mind Badge do Mossdeep Gym. Assim que a Equipe Magma assumir o controle da instalação, o jogador deve eliminar todos os Grunts da Equipe Magma do primeiro andar. Feito isso, os jogadores podem avançar para o segundo andar, onde se encontram com Steven Stone. Stone se junta ao jogador em uma batalha dupla contra Maxie e Tabatha.
