Diferentes subespécies de salamandras e salamandras respiram de maneira diferente em vários estágios da vida. As salamandras sereias usam guelras para respirar durante toda a vida, enquanto as salamandras tigre só usam guelras no início da vida e desenvolvem a capacidade de respirar pelos pulmões desenvolvidos. A maioria das salamandras respira pela pele e pelas membranas localizadas na boca e na garganta, pois não têm guelras ou pulmões para respirar.
Uma razão pela qual diferentes tipos de salamandras respiram de maneira diferente é porque várias subespécies de salamandras habitam ambientes diferentes. Por exemplo, a salamandra sereia deve ser capaz de respirar debaixo d'água, o que explica o uso de guelras durante toda a sua vida. A salamandra tigre perde suas guelras na idade adulta, sendo necessário que ela seja capaz de respirar pelos pulmões.
A maioria das salamandras respira através de uma combinação de pele e membranas na boca e na garganta. Essas salamandras sem lua, assim como outras salamandras, devem ter pele úmida para sobreviver. Salamandras podem morrer se sua pele ficar muito seca ou superaquecida. Enquanto algumas salamandras passam a vida inteira na água para manter a pele úmida, como as salamandras gueladas como as salamandras sereia, outras salamandras procuram ficar fora do sol escondendo-se sob as rochas ou ocasionalmente mergulhando em pequenas poças de água. Algumas salamandras se acostumaram tanto a viver em espaços escuros e úmidos que diminuíram o tamanho dos olhos e a pele pálida.