O conflito principal em "Number the Stars" são os nazistas ocupando a Dinamarca para capturar e enviar judeus para campos de concentração. Especificamente, um conflito surge para os personagens principais quando a família Yohansen arrisca suas vidas ao levando uma jovem judia, Ellen Rosen, para protegê-la dos nazistas.
Existem dois pontos culminantes no romance que destacam o conflito principal em "Número das estrelas". O primeiro evento ocorre quando os soldados vasculham a casa de Yohansen à procura de Ellen e sua família. Depois que os soldados nazistas suspeitam de Ellen, o Sr. Yohansen finge que ela é sua filha, salvando sua vida.
Na segunda cena climática, Annemarie - a filha de Yohansen - é parada por soldados nazistas em seu caminho para entregar um pacote a um homem que está ajudando judeus a fugir para a Suécia. Depois de impedir que os soldados descubram o conteúdo do pacote, Annemarie evita por pouco ser detida.
Além desses eventos, conflitos secundários surgem da ocupação nazista e os efeitos de longo alcance da Segunda Guerra Mundial. Por exemplo, vários personagens perdem seus empregos, casas e até mesmo suas famílias enquanto tentam escapar de serem capturados e enviados para campos de internamento, ou enquanto ajudam judeus a escapar da Dinamarca. Em um nível pessoal, Ellen luta com o conflito de ter que ser corajosa enquanto enfrenta a ameaça de nunca mais ver sua família novamente.
