Existem muitos códigos GameShark para Metroid Fusion no Game Boy Advance, de acordo com BS Free. Para inserir esses códigos, o cartucho do jogo deve ser inserido no dispositivo GameShark e, em seguida, inserido no Game Boy Advance. Primeiro, insira o código de habilitação: "00000F6D 000A" e "100008B4 0007." Inserir esses códigos permite que todos os outros cheats sejam ativados.
Para ativar o código de invulnerabilidade, digite "33001249 0001." Isso faz com que Samus evite danos durante o jogo. Pare o cronômetro de eventos digitando "830008D8 00DA". Os disparos mais rápidos são ativados inserindo "3300124E 0000." Este código permite que Samus faça disparos rápidos sem pausas entre os disparos.
O código "83001252 A001" permite uma corrida rápida, permitindo que Samus corra na velocidade máxima sem fadiga. Para ativar o salto da lua, digite "74000130 03FE" e "83001260 0040." O salto da lua dá a Samus uma altura de salto drasticamente aumentada. Para mísseis infinitos, digite "83001314 03E7". Para ter mísseis máximos, mas não ilimitados, digite "83001316 03E7". O código "33001318 0063" arma Samus com um número infinito de super bombas.
Se um jogador estiver procurando uma forma de jogo extremamente desafiadora, ele pode virar todos os mísseis e bombas com o código "3300131B 0000." Desbloqueie todas as armas, naipes e habilidades especiais antes de obtê-los através do jogo normal, digitando "4300131A FFFF" e "00000003 0002." Digite "820382E4 0000" para suspender o cronômetro do jogo e configurá-lo para 00:00.
