As principais formas de relevo no Mississippi incluem a planície do Mississippi; Planície costeira; zonas húmidas costeiras; Rios Mississippi, Pearl, Big Black e Yazoo; Reservatório Ross Barnett; Mississippi Sound; e lagos Enid, Grenada e Sardis. Outras formas de relevo significativas incluem o rio Pascagoula, o rio Tombigbee, o lago Arkabutla, as montanhas Cumberland, a baía St. Louis, a baía Biloxi, a baía Pascagoula e o delta do Mississippi.
A elevação mais alta no Mississippi está no sopé das Montanhas Cumberland em Woodall Mountain, que mede 807 pés acima do nível do mar, enquanto a elevação mais baixa é encontrada no nível do mar ao longo da Costa do Golfo. A planície costeira do Golfo Oriental cobre a maior parte do estado, incluindo as colinas baixas de Pine Hills e North Central Hills. O Lago Sardis é o maior lago do Mississippi, com uma área de 98.520 acres e volume de 1,51 milhão de pés acre. É alimentado pelo rio Little Tallahatchie. O Delta do Mississippi é a área delimitada pelo rio Mississippi e pelo rio Yazoo e faz parte da planície aluvial do Mississippi. O maior rio do estado é o Rio das Pérolas, que deságua no Golfo do México após um trajeto de 450 milhas. Mississippi Sound é o lar de uma série de pequenas ilhas que fazem parte do Gulf Islands National Seashore, incluindo as ilhas de Petit Bois, Cat, Ship e Horn.