Embora tenha havido uma ocupação japonesa na República das Filipinas entre 1942 e 1945, que foi amplamente ressentida pelos filipinos, desde o final da Segunda Guerra Mundial o Japão tem sido um parceiro comercial vital que ajudou a impulsionar a economia filipina . O Japão também forneceu apoio em 1980 ao novo governo das Filipinas. Recentemente, o Japão também forneceu a tão necessária ajuda às Filipinas para a reconstrução após o tufão Haiyan.
Os japoneses invadiram as Filipinas em 8 de dezembro de 1941 como um movimento estratégico contra os Estados Unidos. Essa invasão começou menos de um dia após o ataque japonês a Pearl Harbor e, eventualmente, os japoneses estabeleceram uma forte presença militar nas Filipinas. Embora os japoneses tenham prometido independência às ilhas após a guerra, a maioria dos filipinos se ressentiu da ocupação e muitos lutaram ativamente contra os japoneses. Eventualmente, os japoneses se renderam e perderam o controle das Filipinas em 1945.
Desde o fim da guerra e da ocupação japonesa, as relações entre os filipinos e japoneses se fortaleceram. Os japoneses serviram como um parceiro comercial essencial para ajudar a reconstruir e estimular a economia filipina, e os japoneses ajudaram na reconstrução do governo filipino na década de 1980. O Japão continua a fornecer ajuda humanitária e econômica às Filipinas, principalmente durante o período de restauração após o tufão Haiyan.
