Existem muitos sites online que permitem aos usuários vender seus cartões Yu-Gi-Oh: dois dos sites mais populares são eBay e TrollAndToad.com. Ambos os sites permitem que os usuários vendam cartões raros como cartas simples e comuns em grandes quantidades.
A partir de 2014, enquanto o TrollAndToad.com exige um vendedor mínimo de $ 10 em cartões com base no guia de preços do site, o eBay permite que os vendedores ofereçam quantos cartões quiserem. O guia de vendas Yu-Gi-Oh do EBay recomenda a oferta de cartões em grandes lotes para aumentar a chance de venda. Para vender cartões raros individuais, como hologramas, o eBay recomenda oferecer incentivos aos compradores, como cartões de bônus se um leilão atingir um determinado preço.