Os cães lendários, Raikou, Entei e Suicune, começam a aparecer aleatoriamente na grama selvagem assim que o jogador derrota o Elite Four e obtém acesso ao Sevii Island Ferry. O jogador pode pegar apenas um dos três em qualquer jogada, e isso depende do Pokémon inicial.
Se o jogador escolher Squirtle como o Pokémon inicial, Raikou aparecerá no jogo. Se o jogador escolher Bulbasaur como titular, Entei aparece; para Charmander, é Suicune. Todos os cães lendários são encontrados aleatoriamente na grama selvagem e sua localização muda sempre que o jogador entra em um prédio ou se move para uma nova área. A melhor maneira de encontrá-los é subir e descer algumas das rotas mais longas de múltiplas áreas no jogo.
