Existem muitos servidores "Minecraft" dedicados ao mod pack Pixelmon, cada um com suas próprias vantagens. Para jogar, primeiro instale o pacote de mods Pixelmon por meio do Technic Launcher ou do carregador de mods Forge e, em seguida, escolha um servidor para ingressar.
O pacote de mods Pixelmon altera o jogo "Minecraft" para criar um híbrido com o jogo "Pokémon". Os usuários iniciantes são solicitados a escolher um Pokémon inicial e, em seguida, têm liberdade para batalhar e capturar outros Pokémon. Pokébolas são criadas usando Apricórnios, lingotes de ferro e botões de pedra. Para lutar com um Pokémon selvagem ou outro treinador, jogue uma Pokébola e acerte o oponente desejado. Isso abre o menu de batalha.
Ao entrar em um servidor Pixelmon, novas opções de jogo surgem. O comércio torna-se disponível, assim como eventos, concursos e formações de grupo. Alguns servidores personalizam o jogo ainda mais, removendo danos de queda, fome e mobs naturais do "Minecraft". Outros servidores se concentram mais no ambiente e criam estruturas elaboradas para os PokéCenters e academias. Em 12 de julho de 2015, os três principais servidores Pixelmon em Pixelmonservers.com são DestinyMC, RC-Pixelmon e PPMC Pixelmon Network.
Muitos servidores Pixelmon de alto volume oferecem serviços pagos, como um aumento na classificação do jogador ou itens raros no jogo. Essas ofertas e taxas variam.
