Em Pokémon Emerald, obtenha Cyndaquil conversando com o Professor Birch após completar a entrada Pokémon Hoenn. Ele oferece um dos três Pokémon iniciais da Geração II: Chikorita, Cyndaquil ou Totodile. Este é apenas um recurso do Pokémon Emerald; os jogadores não recebem a mesma recompensa por completarem o Pokédex em Pokémon Ruby e Sapphire.
O Hoenn Pok? dex contém 202 Pokémon, 135 dos quais foram introduzidos na Geração III. Para completá-lo, os jogadores devem possuir todos os Pokémon apresentados no jogo, incluindo os três Pokémon iniciais: Treecko, Torchic e Mudkip. Como os jogadores só podem escolher um deles no início do jogo, para completar o Pokémon é necessário trocar Pokémon de outras cópias de Pokémon Ruby, Sapphire ou Emerald.
Além disso, existem cinco Pokémon no Pokémon Hoenn que não aparecem no Pokémon Esmeralda e devem ser trocados nas versões Ruby e Sapphire: Meditite, Medicham, Roselia, Zangoose e Lunatone. < /p>
Existem também os lendários Pokémon Jirachi e Deoxys, que não aparecem em nenhum jogo da Geração III sem conexões com outros jogos ou por meio de itens recebidos em eventos especiais do mundo real. Jirachi está disponível apenas no disco de bônus Pokémon Colosseum, completando o canal Pokémon do jogo ou por meio de brindes especiais. O Deoxys só é encontrado no jogo na Ilha do Nascimento, que requer um Ingresso Aurora de um evento da Nintendo para ser acessado.