Não é possível ir para a região de Johto em "Pokémon Leaf Green." No entanto, é possível capturar uma grande variedade de Pokémon da região de Johto após derrotar o Elite Four indo para várias ilhas chamadas Ilhas Sevii.
A primeira Ilha Sevii pode ser alcançada após o jogador derrotar o líder do ginásio da Ilha Cinnabar, Blaine. Depois que o jogador derrotar a Elite Four, ele poderá acessar todas as ilhas Sevii. Pokémon que vêm da região de Johto podem ser encontrados nas Ilhas Sevii, bem como um dos três Pokémon Cão Lendário da região de Johto. O cão Pokémon será Suicune, Entei ou Raikou. O jogo escolhe o cão que tem a vantagem de tipo sobre o Pokémon que o jogador escolheu no início do jogo.
O jogador pode fazer muito mais do que simplesmente pegar Johto Pokémon nas Ilhas Sevii após derrotar a Elite Four. Ele também pode ir para Mt. Ember e recuperar a safira dos capangas da Equipe Rocket ou pegar o rubi de um depósito da Equipe Rocket. A entrada para Cerulean Cave também está desbloqueada para que o jogador possa ir lá e capturar o lendário Pokémon Mewtwo.
