"Pokémon Battle Fire" é feito de um Ruby Rom, então os códigos de trapaça são os mesmos que em Ruby. Embora alguns códigos de trapaça não existam mais devido a pequenas mudanças de jogabilidade, os códigos usam Gameshark ou Action Replay permanecem os mesmos.
"Pokémon Battle Fire" é um jogo feito por um fã que usa um novo arco de história, personagens e Fakemon. Como o Fakemon usa a mesma programação do Pokémon em Ruby, eles são modificados de maneira semelhante. Os códigos que fazem o Pokémon parecer brilhante, por exemplo, ainda podem ser usados, desde que o código esteja ativado.
Pokémon selvagem também pode ser manipulado usando Gameshark ou Action Replay. Embora o jogo seja projetado para exibir 202 Pokémon feitos por fãs, os jogadores são capazes de capturar Pokémon clássicos que estavam disponíveis para Ruby inserindo o código exclusivo. Inserir C7715E5D 4B03490C, por exemplo, faz com que um Bulbasaur selvagem apareça no lugar de um Pokémon normal. Os ovos também podem ser modificados de maneira semelhante.
Os códigos de item também permanecem os mesmos. A maioria dos itens dentro do jogo tem o mesmo nome que no Ruby, o que ajuda a evitar confusão entre os jogadores. Isso significa que os códigos de replicação e códigos de substituição para Ruby ainda podem ser usados. Por exemplo, DCEEEC34 AFEADC26 substitui o primeiro item no PC do usuário por uma bola mestra.