Um código mestre do GameShark é um código primário que precisa ser habilitado antes que qualquer outro código de trapaça possa funcionar. Nem todos os jogos requerem o uso de um código mestre.
Às vezes, é necessário um código mestre como meio de interromper o código do jogo para que os códigos de trapaça possam ser inseridos. O código mestre geralmente altera uma parte do código do jogo que está constantemente sendo executado, como a leitura de entrada do controlador. Alguns exemplos proeminentes de jogos que requerem um código mestre são a série Pokémon e Final Fantasy 7. Os códigos mestre e códigos de trapaça funcionam apenas na memória de acesso aleatório (RAM) e, portanto, não podem alterar permanentemente o código de um jogo, mas jogos salvos feitos enquanto um código é ativos podem ser afetados.