A geografia do New Hampshire colonial era uma variedade de colinas, montanhas, costa baixa e planaltos. As montanhas eram densas de árvores, e o solo em outras áreas era tão rochoso e pobre que tornava a área difícil de cultivar. Os rios Merrimack e Piscataqua formavam as fronteiras da colônia.
A geografia e o clima colonial de New Hampshire dificultaram a agricultura. Foi a mais fria das colônias, com verões curtos e amenos e invernos longos. Mesmo assim, os colonos conseguiram plantar milho, abóbora, feijão, centeio e abóboras. Como a colônia era costeira, os colonos pescavam muito e podiam trocar peixes e madeira de suas florestas para as outras colônias por frutas e vegetais.