A principal forma de doar Beanie Babies ou outros bichinhos de pelúcia para instituições de caridade é enviá-los a Bichos de Pelúcia para Emergências, ou SEGURO. Esta instituição de caridade em particular doará o Beanie Baby diretamente para crianças que estão em necessidade de brinquedos.
Além do SAFE, há os programas Toys for Tots e Battalion Buddies. Toys for Tots é um programa criado para dar brinquedos a crianças carentes nas épocas de Natal e inverno. Normalmente, há um ponto de entrega em uma área designada, como um shopping ou mercearia. Uma pessoa pode pesquisar online por seu local de entrega. As doações também podem ser feitas para a Toys for Tots por meio do site oficial ou em parceria com a Toys 'R Us.
O programa Batalhão de Amigos é projetado para crianças que têm um dos pais no serviço militar ativo. Beanie Babies e outros bichos de pelúcia podem ser doados diretamente para a organização, ou um kit pode ser comprado para que a pessoa doadora possa fazer um Battalion Buddy em casa. O programa Battalion Buddy faz parte da Operação Gratitude, que envia pacotes de cuidados para as próprias tropas.
Cada uma dessas organizações aceita contribuições financeiras como doações, bem como bichos de pelúcia e Beanie Babies.